利用化学反应来处理水中的污染物或悬浮胶粒。包括凝絮、中和、络合、氧化还原、消毒等。
1．凝絮
用无机或有机化学试剂，使水中的微小颗粒及胶体凝聚成大絮凝体，加速沉淀。常用的凝絮剂有铝盐(硫酸铝、铝酸钠、碱式氯化铝等)，以及高分子絮凝剂等。
2．中和
改善水的pH值。常用生石灰或石灰水使水呈中性或弱碱性，还能增加水体中钙的含量，改良底质，并杀灭病原体。pH值过高时，可采用草酸、醋酸等弱酸中和。
3．络合
最常用的是EDTA，主要用于清除水中过高的重金属离子(如Cu2+)，特别是那些鱼贝类敏感的重金属离子。
4．氧化还原
一些含氯消毒剂、臭氧、双氧水、高锰酸钾等可以与水中的有毒物质(如氰离子、硫离子)发生氧化还原反应，降低或消除毒性，还可以杀灭水中的病原菌。常用的含氯消毒剂有漂白粉、二氧化氯、二氯异氰尿酸钠、三氯异氰尿酸等。
臭氧通过强烈的氧化作用除去水中有机物、铁、锰、臭味及色度等，但因它对细菌具有极强的杀灭效果，以致水中的有益菌也被杀死，故只用于较特殊的地方。河蟹育苗水经臭氧处理后，水中的细菌得到了有效抑制，亚硝酸盐大幅度降解，能减少换水量。目前在水产养殖中应用较少，主要用于河蟹育苗、刺海参育苗、鲍鱼育苗等。
5．用其它消毒杀菌剂
常用的有抗生素类、磺胺类、呋喃类、硫酸铜、敌百虫、甲醛、有机染料、双链季铵盐、中草药等。以杀灭水体中的致病生物为主要目标。
中国鳗鱼网报道
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