今天与大家分享一篇来自BMC Genomics的文章：罗非鱼抗水霉感染的转录表达取决于养殖密度，文章引用信息如下:
饲养密度和疾病管理是决定鱼场生产力和盈利能力的关键因素，在水产养殖中，较高密度的养殖会提高机体的皮质醇水平，这可能是由于鱼体的应激反应所引起的。研究表明，饲养条件的不同会造成包括机体免疫信号途径在内的大规模的基因转录差异。然而，这些转录差异如何影响实际感染过程，从而导致机体的易感性差异？本文利用水霉感染不同养殖密度的罗非鱼，分析基因转录水平的差异，以期探索饲养密度对鱼类疾病易感性的影响，从而为水产养殖中有效的疾病管理提供重要的见解。
通过在两种密度下（高密度：6kg/m3；低密度：1.5kg/m3），对罗非鱼感染水霉病的死亡率研究发现，高密度组的死亡率为10.2%（29/285），而低密度组的死亡率为52.1%(38/73)，且幼鱼更易因感染水霉而死亡。密度与鱼体的长度存在显著的相关性（P=0.026），低密度养殖的鱼，平均体长增加。
在鳃组织中，高密度和低密度的两组鱼有175个基因都有较高的表达水平（感染24h和48h）, 且所有受感染的鱼中表达下调的基因主要包括生理过程相关基因，以及MHC II 蛋白。通过差异表达基因分析，发现低密度组的鱼在感染24h后，炎症反应调节基因富集（tnip1, sbno2）；然而，高密度组的鱼在感染24h后增加了一些特定基因的表达，例如免疫球蛋白介导的免疫应答（msh2 , batf ）。此外，T细胞相关的功能基因仅在受感染的高密度养殖鱼中出现，而在感染后的低密度养殖鱼中，MHC II、补体及体液免疫相关基因表达下调。
在皮肤中，低密度鱼在感染24h后，炎性通路相关的基因表达上调，而在高密度鱼中的金属肽酶的活性增强。此外，免疫抑制途径，特别是获得性免疫在两种密度条件下都存在。而在获得性免疫及伤口愈合过程中有明显富集的共表达基因SK1和SK6，与感染状态呈负相关，与养殖密度呈正相关，表明高密度养殖鱼的皮肤中免疫抑制水平较低。
尽管孔雀石绿在防治水霉病方面非常有效，但由于威胁较大，已在2002年在世界范围内被禁止。目前，对于水霉病仍然没有有效的防治措施，因此阐明养殖条件对疾病的易感性至关重要。低密度养殖过程中炎症因子高表达，且免疫抑制因子高表达，导致对水霉的抗性反而降低。而高密度养殖过程中更多的特定免疫因子，包括T细胞免疫因子被激活，且免疫抑制因子水平低，因此反而对水霉的抗性增强。
点评：本文只是对比了每立方6kg和1.5kg两个密度，发现低密度养殖的罗非鱼对水霉反而更敏感。但这并不能说明养殖密度越高越好。对于养殖密度的评估，是与环境的容量、鱼的集群习性、耐低氧能力、抗应激水平等密切相关的，不可一概而论。
中国鳗鱼网报道
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